Κατά κύριο λόγο οι στέγες στον οικισμό του Αγίου Ιωάννη είναι τρίριχτες με μερικές εξαιρέσεις τετράριχτων στεγών. Ο φέρων οργανισμός της στέγης (ζευκτό) είναι ξύλινος και αποτελείται από ελκυστήρες (οριζόντια ξύλινα στοιχεία) πάνω στους οποίους στηρίζονται οι αμείβοντες (κεκλιμένα ξύλινα στοιχεία) και στο ανώτερο σημείο τοποθετείται ο κορφιάς. Τα ζευκτά δε διαθέτουν ορθοστάτες. Επιπλέον, σε πολλές περιπτώσεις, υπάρχουν και ορφανά ξύλινα στοιχεία, σε ρόλο ελκυστήρα, που στηρίζονται κατευθείαν στην ανώτερη ξυλοδεσιά και μαζί με τους αμείβοντες αναλαμβάνουν τη στήριξη των σανίδων που καλύπτουν τον φέροντα οργανισμό. Τελική στρώση της στέγης είναι τα κεραμίδια βυζαντινού τύπου, τα οποία τοποθετούνται με τη χρήση κονιάματος. Τα κενά που δημιουργούνται μεταξύ τοιχοποιίας και κεραμιδιών στο γείσο πληρώνονται με μικρότερες πέτρες.