Οι ξύλινες τοιχοποιίες δεν είναι συχνές, αλλά όταν συναντώνται είναι στον όροφο και πάντα εσωτερικές. Από τα λιγοστά δείγματα που είχαμε συμπεραίνουμε ότι η τεχνική που χτίζονται είναι το μπαγδατί. Αρχικά τοποθετούνται οι ξύλινοι ορθοστάτες σε ίσες αποστάσεις και έπειτα γίνεται πλήρωση των κενών με κλαδιά και λάσπη. Οι δύο παρειές καλύπτονται από καλαμωτή, ώστε να διαμορφώνεται μια πιο τραχιά επιφάνεια με αποτέλεσμα να «πιάσει» το επίχρισμα καλύτερα. Οι εσωτερικές ξύλινες τοιχοποιίες δεν διακόπτουν ποτέ τις πέτρινες αλλά τοποθετούνται εσωτερικά αυτών. Πολλές φορές αν έχει καταρρεύσει η ξύλινη τοιχοποιία μπορούμε να διακρίνουμε τη θέση της από το σόκορο που αφήνει στην πέτρινη, καθώς σε εκείνο το σημείο δεν υπάρχει επίχρισμα.