Οι Άνω Καλάθενες είναι οικισμός που αποτελεί μία από τις τέσσερις γειτονιές της Τοπικής Κοινότητας Καλαθενών που ευρίσκεται εντός των ορίων της Δημοτικής Ενότητας Κισσάμου του ομώνυμου Δήμου, στην περιοχή της δυτικής Κρήτης. Σήμερα, σύμφωνα με το πρόγραμμα «Καλλικράτης» που διαμόρφωσε την υφιστάμενη διοικητική διαίρεση της Ελλάδος, ο Δήμος Κισσάμου ανήκει στην Περιφερειακή Ενότητα Χανίων της Περιφέρειας Κρήτης. Οι Καλάθενες ευρίσκονται σε υψόμετρο 280 μέτρων και απέχουν 50 χλμ από τα Χανιά και 10 χλμ από την πρωτεύουσα του Δήμου που είναι η Κίσσαμος (Καστέλι).
Οι κύριοι οδικοί άξονες που συνδέουν τις Καλάθενες με τους πέριξ οικισμούς, καθώς και την Κίσσαμο, είναι η επαρχιακή οδός Καλουδιανών - Καστελίου καθώς και η επαρχιακή οδός Τοπόλια - Καλάθενες. Η πρώτη διέρχεται μέσα από την γειτονιά των Άνω Καλαθενών και με βόρεια κατεύθυνση οδηγεί προς το Καστέλι, ενώ με νότια προς τα Καλουδιανά που είναι γειτονικός οικισμός. Σημαντική είναι η σύνδεση του οικισμού με τα Τοπόλια, δεδομένου ότι αυτά αποτελούν κεφαλοχώρι της περιοχής. Οι δύο αυτές επαρχιακές οδοί διασταυρώνονται βόρεια των Άνω Καλαθενών. Μέσω αυτών πραγματοποιούνται δρομολόγια λεωφορείων από το Καστέλι προς τους οικισμούς της περιοχής.