Τα κουφώματα της Σαντορίνης παρουσιάζουν ορισμένες ιδιαιτερότητες σε σχέση με άλλους παραδοσιακούς οικισμούς. Κύρια διαφορά είναι ότι τα παράθυρα είναι τοποθετημένα ανάποδα. Το μπατζούρι είναι από μέσα ενώ το τζάμι είναι εξωτερικά. Αυτό οφείλεται στο ότι οι άνεμοι που φυσούν συχνά στο νησί μπορούν εύκολα να καταστρέψουν το μπατζούρι οπότε πρέπει να προστατευτει. Τα κουφώματα περιβάλλονται από ένα παραδοσιακό υλικό, την τοπική πέτρα που λέγεται βασάλτης. Το ίδιο συμβαίνει και στις πόρτες είτε αυτές είναι εισόδου είτε αυλόπορτες.Στο πρέκι των κουφωμάτων τοποθετείται μία μεγάλη και μακρόστενη πέτρα για στήριξη. Οι παραθύρες της κάναβας συνήθως δεν είχαν τζαμιλίκι και η χρήση τους ήταν για αερισμό.
Συνήθως, για τον καλύτερο αερισμό , η τοποθέτηση των κουφωμάτων ήταν η εξής : Πόρτα εισόδου στο κέντρο και δεξιά και αριστερά της βρίσκονται όμοια παράθυρα. Πάνω απο την πόρτα βρίσκεται το παράθυρο ,φεγγίτης, που η χρήση του δεν είναι μόνο για φωτισμό αλλά και για αερισμό κυρίως στις υπόσκαφες κατοικίες.