Με την μεταφορά της πρωτεύουσας τα Φηρά αποτέλεσαν το διοικητικό και εμπορικό κέντρο του νησιού, αργότερα όμως με την αποκέντρωση έχασαν το χαρακτήρα της πρωτεύουσας. Το Κοντοχώρι δημιουργήθηκε λίγο μετά και εξελίχθηκε παράλληλα με τα Φηρά και σε άμεση σχέση με αυτά.
Ο πρώτος οικισμός, στην περιοχή που εξελίχθηκε στο Κοντοχώρι, βρισκόταν στο πέταλο που ονομάζεται Λαγκάδι και στην συνέχεια άρχισε να επεκτείνεται νοτιότερα. Πέρα από αυτόν τον πολύ πρωταρχικό πυρήνα, το μεγαλύτερο περιφερειακό κομμάτι του οικισμού, κυρίως κατά μήκος των οδικών αξόνων που τον περικλείουν, είναι αρκετά μεταγενέστερο. Εξαιρέσεις αποτελούν ορισμένα παλιά αρχοντικά που βρίσκονταν λίγο πιο έξω από το κέντρο του χωριού κι έχουν πλέον ενσωματωθεί σε αυτό.
Μετά τον μεγάλο σεισμό του 1956 και τις πολλές καταστροφές που αυτός προκάλεσε, δημιουργήθηκε επιτακτική ανάγκη για την ανάπλαση κάποιων οικισμών ή τμημάτων τους για την γρήγορα στέγαση των αστέγων που προέκυψαν εξ αιτίας αυτού. Έτσι ανατέθηκε στον Κ. Δεκαβάλλα η λεγόμενη ανοικοδόμηση της Σαντορίνης. Εκείνος ασχολήθηκε με 11 οικιστικά συγκροτήματα. Στα 10 επεκτάθηκαν οι υφιστάμενοι οικισμοί και ένας καινούριος δημιουργήθηκε, το Καμάρι. Τα Φηρά ήταν από τους οικισμούς που επεκτάθηκαν και έτσι δημιουργήθηκε η ενδιάμεση αυτή περιοχή που γεφυρώνει πλέον την απόσταση ανάμεσα στο Κοντοχώρι και τα Φηρά.