Τα βουνά της Ηπείρου και ειδικότερα τα Ζαγοροχώρια είναι πυκνόφυτα, καταπράσινα σε αυτά τα υψόμετρα με φυλλοβόλα δέντρα. Το χειμώνα που χάνουν τα φύλλα τους το σκηνικό γίνεται διαδοχικά από πράσινο πορτοκαλί, κόκκινο και μετά γκρι, συνοδεύοντας το χρώμα της συννεφιάτικης μέρας. Αυτά, σε συνδυασμό με το ανοιχτό γαλάζιο χρώμα των διάφορων ποταμών, παραποτάμων και ρυακιών αλλά και των γκρι χρώματος βράχων που απαρτίζουν κατά κύριο λόγο την οροσειρά, δημιουργούν ένα πολύ έντονο χρωματικά φυσικό τοπίο, άξιο προς θαυμασμό κάθε εποχή του χρόνου. Οι οικισμοί που μπορούν να βρεθούν σε αυτό, όπως και το Καπέσοβο, αναγερμένα με τη χρήση υλικών που βρίσκονται στην περιοχή και όντας ιδιαίτερα λιτά στην εξωτερική τους εμφάνιση, δένονται με το περιβάλλον τους, εντείνοντας την αρμονία και τη γαλήνη της περιοχής. Η Β. Πίνδος, εμφανίζει έναν από τους υψηλότερους δείκτες ποικιλότητας τύπων οικοτόπων στην ορεινή Ελλάδα. Το Καπέσοβο, αποτελεί οικισμό σε αυτήν τη γεωγραφική περιοχή.
Η περιοχή του Ζαγορίου, ειδικά στο σημείο του Καπεσόβου, αποτελείται από δασική βλάστηση. Στα χαμηλότερα υψόμετρα, εμφανίζεται βλάστηση με μεσογειακά στοιχεία (αείφυλλα πλατύφυλλα), ακολουθεί η ζώνη της δρυός (βελανιδιάς), και στα αμέσως μεγαλύτερα υψόμετρα κυριαρχούν τα κωνοφόρα με χαρακτηριστικότερη τη Μαύρη Πεύκη, ενώ πιο ψηλά εμφανίζονται τα δάση οξιάς και ρόμπολου. Οι λιβαδικές και οι στεππόμορφες εκτάσεις εμφανίζονται εμφανίζονται πάνω από τα όρια του δάσους. Το Καπέσοβο σαν οικισμός βρίσκεται σε υψόμετρο όπου η βλάστησή του αποτελείται τόσο από βελανιδιές όσο και από κωνοφόρα δέντρα, έχοντας όμως θέα σε κάθε επίπεδο δάσους που απαριθμήθηκε προηγουμένως
Είναι πολύ δύσκολη η καταγραφή της χλωρίδας και της πανίδας συγκεκριμένα στην περιοχή γύρω του οικισμού του Καπεσόβου αλλά αυτός ανήκει στη μεγαλύτερη έκταση του Ζαγορίου, για τον οποίο, υπάρχουν πληροφορίες:
Χλωρίδα: Η περιοχή θεωρείται από τις πιο πλούσιες σε αριθμό ειδών. Συνολικά στην περιοχή καταγράφηκαν 1700 είδη και υποείδη χλωρίδας, ανάμεσα στα οποία συγκαταλέγονται 6 τοπικά ενδημικά, από τα οποία τα τρία βρίσκονται στην χαράδρα του Αώου και άλλα τρία στην αλπική περιοχή της Τύμφης. Στην περιοχή επίσης υπάρχουν άλλα 35 είδη, ενδημικά της Ελλάδας και 121 είδη που είναι ενδημικά των Βαλκανίων
Πανίδα: Η έκταση της περιοχής και ο κυρίαρχος δασικός και ορεινός χαρακτήρας της χαρακτήρας, εξασφαλίζει ιδανικές συνθήκες διαβίωσης μεγάλης ποικιλίας δασόβιων θηλαστικών ειδών, όπως είναι η καφέ αρκούδα , το ζαρκάδι , το αγριόγιδο , καθώς και για πολλά είδη πουλιώνΕπίσης, καταγράφηκαν στη περιοχή 167 είδη ορνιθοπανίδας, εκ των οποίων τα 48 είναι είδη προτεραιότητας. 84 είδη είναι μόνιμα στην περιοχή, ενώ 22 την επισκέπτονται κατά τη διάρκεια της ανοιξιάτικης ή της φθινοπωρινής μετανάστευσης.Η πανίδα των αμφιβίων και των ερπετών είναι, επίσης, πολύ σημαντική. Εντοπίστηκαν 20 είδη ερπετών και 10 είδη αμφιβίων