Γενική Εικόνα - Σχέση με το Φυσικό Περιβάλλον

Η Κουκουναρά είναι αμφιθετρικά χτισμένη στη βορειοδυτική πλαγία ενός κατάφυτου λόφου, γεγονός καθόλου ευνοϊκό για τον ηλιασμό του, με θέα προς τον κόλπο Κισσάμου. Ο οικισμός είναι περιτριγυρισμένος από πυκνούς ελαιώνες, έτσι παρατηρώντας τον από μακρυά δίνει την εντύπωση ενός νησιού μέσα σε μία χρυσοπράσινη θάλασσα. Το χαμηλότερο σημείο του χωριού βρίσκεται σε υψόμετρο 200 μέτρων, ενώ στο υψηλότερο του σημείο βρίσκεται η μία και μοναδική του εκκλησία σε υψόμετρο περίπου 250 μέτρων. Στη χλωρίδα της περιοχής, πέρα από τις ελιές, συναντάμε αρκετά κυπαρίσσια, πουρνάρια, διάφορα μυρωδικά βότανα και θάμνους και μερικά πλατάνια βαθιά στις ρεματιές. Η πανίδα της περιοχής δεν περιλαμβάνει κάτι το αξιόλογο.