Στο Εκκλησοχώρι δεν υπάρχει συγκεκριμένος διαχωρισμός σε μικρότερες ενότητες όπως μαχαλάδες. Βέβαια, διακρίνουμε ορισμένες επιμέρους οικιστικές ενότητες βάσει των γειτονιών στις οποίες ανήκει το κάθε κτήριο. Η κάθε οικιστική ενότητα χαρακτηρίζεται και από ένα τοπόσημο το οποίο χρησιμοποιείται από τους κατοίκους ως προσφώνηση για την εκάστοτε γειτονιά. Συγκεκριμένα συναντάμε τις ενότητες του Αγίου Αθανασίου, της παλιάς πλατείας, του κέντρο του χωριού, της Αγίας Παρασκευής καθώς και ορισμένες κατοικίες που ανήκουν στα περίχωρα του οικισμού.