Η Μεσσαριά είναι ένας από τους πιο γνωστούς οικισμούςτης Σαντορίνης. Διοικητικά ανήκει στο τοπικό διαμέρισμα Μεσσαριάς του δήμου Θήρας με ένα τμήμα του να εκτείνεται στη περιοχή της Καλντέρας. Γεωγραφικά η Μεσαριά βρίσκεται στο κέντρο βάρους του νησιού και αποτελεί ένα αληθινό σταυροδρόμι καθώς βρίσκεται πάνω στους άξονες που οδηγούν σε άλλουςσημαντικούς οικισμούς ,γεγονός το οποίο επηρέασε την εξέλιξη του οικισμού μέσα στο χρόνο. Η απόσταση του οικισμού σε σχέση με τηθάλασσα είναι 1.52χιλ. από τη Καλντέρα (Δυτικά) και προς ανατολάς 3.43χιλ. Η Μεσσαριά αποτελεί κεφαλοχώρι καθότι νότια είναι σε επαφή με το Βόθωνα και στην ευρύτερη ζώνη χωρίς άμεση σύνδεση με οδικό δίκτυο με τον Πύργο και την Επισκοπή. Προς βορά συνδέεται με οδικό δίκτυο με τον Καρτεράδο σε απόσταση 1300μ., ανατολικά σε απόσταση 3χιλ. συνδέεται με το αεροδρόμιο, την Αγία Παρασκευή και τον Μονόλιθο ο οποίος ανήκει στην τοπική κοινότητα Μεσσαριάς. Στα δυτικά η Μεσσαριά συνδέεται διοικητικά μέχρι και την Καλντέρα.Η απόσταση του οικισμού από τα χωριά τουνησιού είναι η εξής:
Μεσαριά‐Ακρωτήρι: 9.0χιλ.
Μεσαριά‐Θήρα: 3.0χιλ.
Μεσαριά‐Οία: 14.6χιλ.
Μεσαριά‐Καμάρι: 4.6χιλ.
Μεσαριά‐Περίσσα: 10.9χιλ.